-Laboratório I e III: Ocorrem usualmente atividades de higienização, inventário, catalogação, acondicionamento e análise de materiais provenientes das pesquisas arqueológicas.

-Laboratório II: Utilizado quase que de forma exclusiva para a conservação e o restauro dos artefatos, uma das etapas do processo curatorial pelo qual é submetido o acervo.

-Reserva Técnica I: É o espaço de guarda definitiva do material arqueológico, com 157,97m² de área e capacidade de armazenamento no seu arquivo deslizante, de pouco mais de 214 m³ de material, equivalente a uma média de 3.000 caixas engradados.

-Reserva Técnica II: É o espaço de guarda definitiva do material arqueológico, com 30,09 m² de área e capacidade de armazenamento no seu arquivo deslizante, de pouco mais de 40 m³ de material, equivalente a uma média de 600 caixas engradados.

Sala de aula: Destinada a apoiar as atividades de ensino e extensão, sobretudo promovendo o conhecimento acerca da diversidade cultural e socioambiental dos povos da Amazônia, a partir das evidências materiais representativas do passado e do presente.